Plus-values comme moins-values de cession relèvent du régime des plus-values privées. La plus-value du LMNP est égale à la différence entre le prix de cession et le prix d'acquisition, diminuée d'un abattement de 10% par année de détention après la 5ème année. Un abattement de 1000 euros est ensuite pratiquée sur cette plus-value.
L'imposition est égale à 16% (art 200 B du CGI) augmentée des prélèvements sociaux, soit 11% depuis janvier 2005. Le taux global d'imposition s'établit donc à 27%.

